Follow Us @soratemplates

Thursday, 24 May 2018


Tomato ringspot virus


Salbiah
Balai Uji Terap Teknik dan Metode Karantina Pertanian


     Nama ilmiah : Tomato ringspot virus

     Nama umum : Ringspot of tomato

     Nama ilmiah lainnya :
     blackberry (Himalaya) mosaic virus
     euonymus chlorotic ringspot virus
     euonymus ringspot virus
     grape yellow vein virus
     grapevine yellow vein virus
     nicotiana 13 virus
     peach stem pitting virus
     prune brown line virus
     prunus stem pitting virus
     red currant mosaic virus
     tobacco ringspot virus 2
     tomato ringspot nepovirus
     ToRSV
     winter peach mosaic virus


     Kode EPPO : TORSV0 (Tomato ringspot nepovirus

    Taksonomi :

Domain: Virus

Group: "Positive sense ssRNA viruses"

Group: "RNA viruses"

Famili: Comoviridae

Genus: Nepovirus

Spesies: Tomato ringspot virus


Deskripsi :

ToRSV memiliki partikel isometrik berdiameter 28 nm (Stace-Smith, 1984). Virion tidak terbungkus, bersudut dan tidak memiliki susunan kapsul yang mencolok. Genom terdiri dari RNA beruntai tunggal dalam dua bagian. Virion ditemukan di mesofil, sitoplasma dan plasmodesmata. Inklusi hadir pada sel yang terinfeksi dan tidak biasa dalam bentuk; Mereka adalah vakuola besar di sitoplasma atau kristal yang terdiri dari nukleoprotein (VIDE).

Sebaran :
ToRSV adalah endemik di Amerika Utara, di mana ia terjadi di sepanjang pantai Pasifik dari British Columbia selatan ke California dan di daerah sekitar Semenanjung Niagara di Ontario dan negara bagian yang berdekatan dengan New York dan Pennsylvania. Ini menyebabkan masalah penyakit serius di daerah di mana vektor nematoda juga terjadi. Penyebaran alami terbatas pada daerah-daerah di mana terdapat populasi vektor nematoda moderat hingga tinggi yang termasuk genus Xiphinema (Stace-Smith, 1984).

Virus ini telah diisolasi dari tanaman hias dan berry di bagian lain dunia namun ada sedikit bukti penyebaran lapangan (Stace-Smith, l984). Isolasi telah dilakukan dari narcissus di Jepang (Iwaki dan Komuro, 1971), pelargonium di Swedia (Ryden, 1972), Inggris (Hollings et al., 1972), Belanda (Maat dan van Hoof, 1974) dan Denmark (Christensen dan Paludan, 1978), raspberry (Rubus) di Yugoslavia (Jordovic et al, l972), bekas Uni Soviet (Gordejchuk et al., 1977) dan Chile (Auger and Converse, 1982) dan red currant (Ribes) di Selandia Baru ( Fry and Wood, 1978) dan bekas USSR (Gordejchuk et al., 1977).

ToRSV telah terdeteksi dua kali di Australia (Chu et al., 1983; Cook dan Dube, 1989). Kedua pendeteksian tersebut dibuat pada tanaman hias dan tidak ada bukti penyebaran dari deteksi terisolasi ini yang tercatat. Meskipun program pemantauan dan pengujian dirancang khusus untuk mendeteksi virus ini yang dilakukan oleh petugas pertanian negara bagian dan teritori serta Australian Quarantine and Inspection Service (AQIS), tidak ada deteksi lebih lanjut dari patogen ini yang telah dibuat. ToRSV sekarang diperkirakan akan dikendalikan dari Australia.
Asia : Cina, Iran, Jepang, Yordania, Korea, Oman, Pakistan, Turki, Taiwan.
Afrika : Mesir, Tunisia.
Amerika Utara : Kanada, Meksiko, California, Kansas, Florida, New York, Kentuky, Oklahoma, Pensilvania, Texas, Cili, Venezuela.
Eropa : Belarus, Belgia, Bulgaria, Kroasia, Republik Ceko, Denmark, Finlandia, Perancis, Jerman, Irlandia, Italia, Lithuania, Belanda, Norwegia, Portugal, Rusia, Serbia, Slovakia, Swedia.
Oceania : Australia, New Zealand.

Resiko pemasukan :
Sebagian besar spesies yang terinfeksi ToRSV cenderung pulih sehingga tidak ada gejala yang jelas, sehingga menyulitkan petugas phytosanitary untuk mendeteksi secara visual bahan tanaman yang terinfeksi. Terlepas dari karakteristik ini, virus dianggap sebagai risiko phytosanitary minor. Ini karena prosedur deteksi yang efektif tersedia dan program pengindeksan patogen terdapat di Kanada dan Amerika Serikat. Akibatnya, virus tersebut tidak disebarkan oleh aktivitas manusia di luar area dimana endemik. Stok pembibitan yang terkontaminasi tidak dianggap sebagai sumber infeksi yang penting. Akan tetapi, kemungkinan distribusi barang yang terkontaminasi secara tidak disengaja memainkan peran penting dalam mengenalkan virus tersebut ke lahan pertanian yang baru dibersihkan selama satu abad atau lebih.
Secara umum bahwa virus tersebut dibatasi dalam distribusi alami ke wilayah tertentu di Amerika Utara, terutama di sekitar Danau Besar dan Kawasan Pasifik, daerah dimana vektor nematoda juga lazim. Virus ini telah diisolasi dari tanaman hias dan berry di bagian lain dunia namun ada sedikit bukti penyebaran lapangan yang terkait dengan kejadian terisolasi ini (Stace-Smith, l984). Isolasi telah dilakukan dari narcissus di Jepang (Iwaki dan Komuro, 1971), pelargonium di Swedia (Ryden, 1972), Inggris (Hollings et al., 1972), Belanda (Maat dan van Hoof, 1974) dan Denmark (Christensen dan Paludan, 1978), raspberry (Rubus) di Yugoslavia (Jordovic et al, l972), bekas Uni Soviet (Gordejchuk et al., 1977) dan Chile (Auger and Converse, 1982) dan red currant (Ribes) di Selandia Baru ( Fry and Wood, 1978) dan bekas USSR (Gordejchuk et al., 1977).
Gejala : Gejala ToRSV sangat berbeda pada tanaman yang berbeda. Pola Oakleaf, ringspot atau yellow blotch pada dedaunan host abadi biasanya diamati pada tahun selanjutnya setelah infeksi, namun pada tahun-tahun berikutnya, penurunan umum pada pertumbuhan tanaman dan penurunan buah lebih sering terjadi daripada gejala khas lainnya.
Gejala penyakit raspberry berbeda tergantung kultivar, durasi infeksi dan stadium pertumbuhan tanaman. Tanaman biasanya tidak menunjukkan gejala pada tahun mereka terinfeksi tetapi pada musim semi tahun berikutnya,beberapa daun menunjukkan cincin kuning, pola garis, atau klorosis vena. Gejala ini dapat dianggap sebagai reaksi kejutan karena gejala daun yang berbeda jarang terjadi pada tahun-tahun berikutnya. Gejala kronis termasuk tebu berbuah yang terlambat, berbagai  klorosis pada daun, pengurangan hasil, buah yang cacat atau rapuh (Stace-Smith dan Converse, 1987).

Virus ringspot tomat pada Prunus spp. (Persik, nektarin, ceri manis, almond dan plum) menyebabkan berbagai gejala buah, tunas, daun, dan batang. Gejala pertama pada pohon peach atau nektarin yang baru terinfeksi adalah perkembangan bercak atau bintik kuning pada bilah daun. Secara garis besar, berbulu dan biasanya mengikuti pembuluh darah utama. Bintik-bintik biasanya terjadi pada bagian dasar daun dan didominasi pada satu sisi pelepah. Blotching disertai distorsi daun, yang berupa menjepit, mengerut, membungkuk dan membelah lateral ke daerah klorosis. Area klorotik sering mati, mengakibatkan lubang dan tattering. Pada pohon yang terinfeksi kronis, gejala kera-mosaik kuning paling jelas pada musim semi saat daun baru tumbuh. Pertumbuhan beberapa tunas sangat terbelakang, menghasilkan daun kuning pucat dan berubah menjadi coklat dan mati, menyebabkan kuncup yang terkena menonjol kontras dengan daun yang muncul normal yang terkait dengan tunas lain di cabang yang sama atau di bagian pohon yang lain. Tunas yang terkena memiliki dedaunan yang agak jarang, penampilannya yang terbuka. Virus bergerak perlahan ke atas sehingga, setelah beberapa tahun, buah diproduksi hanya di cabang. Gejala dapat bervariasi tergantung pada umur pohon atau durasi infeksi dan perubahan iklim dari tahun ke tahun (Smith dan Traylor, 1969; Smith et al., 1973; Schlocker dan Traylor 1976). Buah tidak normal, daun nekrotik, warna tidak normal, dieback.

Biologi dan ekologi :
ToRSV memiliki distribusi geografis yang luas di Amerika Utara dan mampu menginfeksi tanaman liar dan budidaya. Terjadinya penyakit dahsyat yang terkait dengan virus ini berkorelasi dengan terjadinya populasi vektor nematoda yang tinggi milik genus Xiphinema. Jika virus disebarluaskan dalam menanam bahan ke daerah dimana Xiphinema spp. Tidak ada atau ada dalam jumlah rendah, biasanya tidak penting.
Sebagian besar studi vektor telah dilakukan dengan populasi nematoda yang diidentifikasi sebagai Xiphinema americanum. X. americanum, X. rivesi dianggap sebagai vektor virus yang penting di Amerika Serikat bagian timur (Forer and Stouffer, 1982; Rosenberger et al., 1983; Mountain et al., 1983) dan X. californicum di USA bagian barat (Hoy et al., 1984). Virus ditransmisikan pada tahap dewasa dan larva X. americanum, diperoleh dalam waktu satu jam dan dapat diinokulasi ke tanaman sehat dalam waktu satu jam (Teliz et al., 1966). Dalam penanaman raspberry, penyebaran rata-rata sekitar 2 m per tahun (Converse dan Stace-Smith, l971). Dimana penyebaran aktif terjadi, virus bergerak lebih cepat dari tanaman ke tanaman di sepanjang baris daripada bergerak di antara baris (Stace-Smith dan Converse, 1987).
Stok pembibitan yang terkontaminasi tidak dianggap sebagai sumber infeksi yang penting. Karena virus ini biasa terjadi di kebun apel dan bertahan dalam proporsi benih dari tanaman yang terinfeksi, benih dandelion yang terinfeksi diperkirakan merupakan sumber utama penyebaran antar kebun dan intra-kebun. Nematoda vektor, yang lazim di banyak kebun buah, dapat memperoleh virus dari host gulma kebun dan memindahkannya ke pohon apel (Powell et al., 1984).

Aspek terbawa benih :
ToRSV telah terbukti terbawa benih di beberapa spesies termasuk kacang kedelai (Kahn, 1956; D McGee, Iowa State University, Iowa, Amerika Serikat, stroberi (Mellor dan Stace-Smith, 1963), raspberry (Braun dan Keplinger, 1973), pelargonium (Scarborough dan Smith, 1977) dan dandelion (Mountain et al., 1983). Transmisi serbuk sari ke benih telah ditunjukkan pada pelargonium (Scarborough dan Smith, 1977).

Raspberry yang terinfeksi ToRSV dapat menunjukkan ukuran berry yang abnormal dan berry yang rapuh karena infeksi mempengaruhi kualitas benih. Dalam penelitian yang melibatkan 10 kultivar, beberapa menunjukkan penurunan hasil pada tahun tanam ketiga sedangkan varietas lainnya tidak menunjukkan penurunan hasil yang signifikan (Freeman et al., 1975). Drupelet set juga bervariasi dengan kultivar, beberapa menunjukkan efek yang sangat merugikan sedangkan yang lain tidak terpengaruh atau terpengaruh pada tingkat yang lebih rendah (Daubeny et al., 1975).

Kecuali stroberi (Mellor dan Stace-Smith, 1963), tidak ada bukti yang meyakinkan untuk mentransmisikan ToRSV dari benih ke bibit di inang manapun. Benih yang dipanen dari tanaman kedelai yang diinokulasi ditanam di rumah kaca ditanam di rumah kaca dan patogen tercatat pada 76% bibit. Kehadiran virus pada bibit berumur 3 minggu dikonfirmasi oleh perkembangan gejala dan dengan menginokulasi jaringan ke tanaman indikator (Kahn, 1956). Namun, tidak ada indikasi bahwa tindakan pencegahan dilakukan dalam penelitian ini untuk mencegah sumber inokulum alternatif. Selanjutnya, transmisi benih belum ditunjukkan oleh bibit dari tanaman kedelai yang terinfeksi secara alami.

Laboratorium Pengujian Benih Laboratorium Universitas Iowa State telah mengadaptasi sebuah kit diagnostik yang diproduksi oleh Agdia Unc, Elkhart, Indiana, AS, untuk menguji ToMRV dalam biji. Metode ini tersedia di website Sistem Benih Kesehatan USDA.

Virus tersebut telah terdeteksi pada benih stroberi yang terinfeksi dengan cara menabur benih dan mentransmisikan virus secara mekanis dari bibit yang terinfeksi ke tanaman uji.

Dampak :
ToRSV tersebar luas pada banyak spesies tanaman dan menyebabkan penurunan produktivitas yang parah sehingga merupakan salah satu virus tanaman yang paling merusak di Amerika Utara. Virus ini lazim terjadi pada dandelion dan gulma lainnya (Powell et al., 1982), dan dapat disebarluaskan pada jarak yang cukup jauh pada biji windwown dari dandelion yang terinfeksi (Rosenberger et al., 1983). Selanjutnya, dandelion dan gulma lainnya menyediakan reservoir untuk akuisisi virus oleh vektor nematoda.

ToRSV merupakan masalah ekonomi yang serius di daerah di mana vektor nematoda terjadi (lihat Biologi dan Ekologi). Untungnya,  penyebaran virus aktif dibatasi pada jenis tanah tertentu. Di wilayah yang berkembang dengan raspberry di Pacific Northwest, misalnya, relatif sedikit yang terinfeksi, namun di mana virus ini lazim, kehilangan panen sangat luas (Converse et al., 1970).

Penurunan hasil di berbagai inang sulit untuk dinilai karena respon terhadap infeksi bervariasi sesuai dengan kultivar dan durasi infeksi. Dalam penelitian tentang raspberry, antara 10 dan 80% batang raspberry mati sebagian atau seluruhnya 3 tahun setelah terinfeksi (Freeman dan Stace-Smith, 1968). Dalam studi lapangan lainnya, Converse dan Stace-Smith (1971) mengamati bahwa buah dari tebu yang terinfeksi beratnya 21% kurang dari buah normal dan hasil tanaman berpenyakit berkurang sebesar> 50%.

Diagnosis :
Dua tes untuk diagnosis ToRSV berguna: transmisi dari inang ke inang atau tes serologis. Transmisi Sap dari inang yang terinfeksi ke spesies inang didapat sehingga menghasilkan jaringan daun digunakan sebagai sumber inokulum. Penyangga fosfat (0,02 M, pH 7,5, mengandung 2% nikotin) dapat digunakan. Inang indikator yang paling berguna adalah Chenopodium quinoa dan Cucumis sativus.
Bioassays dan agar gel serologi efektif digunakan dengan dedaunan yang diproduksi di musim semi, namun seiring dengan berkembangnya musim panas, menjadi sulit untuk mendeteksi infeksi. Uji immunosorbent enzyme-linked (ELISA) adalah yang paling dapat diandalkan dan dapat digunakan untuk mendeteksi virus pada sampel daun, batang, tunas dan akar dari tanaman yang terinfeksi (Converse, 1978). ELISA sekarang banyak digunakan untuk survei lapangan.
Tes serologis memiliki keuntungan tambahan bahwa virus diidentifikasi secara spesifik, sedangkan bioassay dapat mendeteksi infeksi nepovirus namun tidak cukup berbeda untuk menentukan identitas nepovirus yang tepat.
Virus ringspot tomat terdeteksi dengan tepat menggunakan uji RT-PCR real-time oleh Zhu et al. (2003). DAS-ELISA, PCR multipleks dan PCR semi-nested juga telah berhasil digunakan (Wen et al 2007; Cui et al., 2012).

Deteksi dan infeksi :

Masalah yang dihadapi dalam deteksi dan identifikasi ToRSV pada raspberry adalah masalah dalam mendeteksi virus di inang lainnya. Infeksi pada raspberry dapat dideteksi melalui pemeriksaan di lapangan, terutama jika survei dilakukan di musim semi ketika gejala dedaunan paling menonjol (Vaughan et al., 1951; Converse et al., 1970). Survei lapangan mendeteksi tingginya proporsi infeksi baru namun proporsi tanaman kronis yang terinfeksi. Beberapa kultivar sensitif menunjukkan tanda-tanda foliar  di tahun-tahun terakhir; Kultivar lain tidak menunjukkan gejala (Stace-Smith dan Converse, 1987).

Selama bertahun-tahun, para pekerja mengandalkan gejala lapangan untuk deteksi dan inspeksi. Karena tidak adanya gejala tidak berarti tidak adanya infeksi, pemeriksaan visual harus dilengkapi dengan tes yang mampu mendeteksi infeksi laten. Inspeksi visual biasanya dilengkapi dengan transmisi ke indikator tanaman atau tes serologis.

Identifikasi vektor nematoda potensial, populasi mereka di berbagai kedalaman tanah, dan distribusi lapangan mereka juga penting dalam mengendalikan virus, terutama pada tanaman tahunan. Seseorang melakukan sampling sebelum menanam ladang baru atau menanam kembali ladang lama. Vektor adalah ektoparasit dan lebih mudah untuk sampel dari endoparasit. Faktor-faktor seperti waktu tahun, tipe dan tekstur tanah, sistem akar tanaman tanaman dan gulma dan drainase tanah memiliki pengaruh pada sampel dalam penilaian yang akurat terhadap populasi nematoda. Persentase tinggi kebun buah dan kebun anggur di Amerika Utara telah ditanam tanpa sampling nematoda sebelumnya. ToRSV dan penyakit nepovirus lainnya menjadi jelas dalam penanaman tanaman berkayu, para petani menjadi sadar akan kebutuhan untuk melakukan sampeling nematoda sebelum penanaman (Stace-Smith dan Ramsdell, 1987).

Pencegahan dan pengendalian :
Infeksi ToRSV biasanya tidak terdeteksi pada penanaman lahan tanaman tahunan sampai virus tersebut menyebar. Pada tahap ini sedikit yang bisa dilakukan untuk mencegah virus dan pengendaliannya yang sulit. Tanaman yang menunjukkan gejala dapat dihilangkan dan ditanam kembali dengan persediaan yang sehat.

Stok tanaman uang bebas virus adalah fondasi untuk pencegahan penyakit nepovirus. Di California, Amerika Serikat, jutaan selai grapevine dan kultivar yang dicangkokkan ke batang bawah disebarkan bebas dari virus sebagai akibat kultur thermotherapy dan shoot-tip (Nyland dan Goheen, 1969). Perkembangan terbaru dalam metode deteksi dan virus telah menghasilkan prosedur terapeutik yang efektif (Spiegel et al., 1993).
Meskipun penyebaran tomat ringspot nepovirus dari Amerika Utara ke daerah lain di dunia terbatas, ada cukup banyak laporan dalam literatur untuk menarik perhatian. Mengumpulkan, konservasi dan pemanfaatan sumber daya genetik tanaman dan distribusi global mereka merupakan komponen penting dalam program peningkatan tanaman. Tak pelak lagi, pergerakan plasma nutfah melibatkan risiko tanpa sengaja mengenalkan hama karantina tumbuhan bersamaan dengan bahan tanaman inang, terutama dengan virus seperti tomat ringspot nepovirus yang sering tanpa gejala. Volume plasma nutfah yang terus meningkat yang dipertukarkan secara internasional telah menciptakan kebutuhan akan keamanan fitosanitasi transfer plasma nutfah. Hal ini mendorong pengembangan pedoman dan rekomendasi yang diterima secara internasional untuk pergerakan plasma nutfah yang aman dan cepat (Frison and Ikin, 1991; Dickmann et al., 1994). Rekomendasi umum adalah bahwa dalam keadaan apapun plasma nutfah tidak dipindahkan sebagai bahan tanaman yang berakar, Plasma nutfah sebaiknya dipindahkan sebagai kultur in vitro, bila tersedia, aksesi atau kultivar harus diperoleh dari koleksi yang diuji patogen atau dari area dengan risiko terendah dan semua bahan harus menjalani prosedur dan pengindeksan (Spiegel et al., 1993).
Banyak perhatian telah diberikan pada kemungkinan gulma pada epidemiologi dan penyebaran nepovirus ringspot tomat. Dalam sebuah penelitian untuk menilai tingkat gulma kebun yang terinfeksi dengan tomat ringspot nepovirus di apel yang sakit dan kebun buah persik di Amerika Serikat bagian timur, 21 spesies gulma tahunan ditemukan terinfeksi virus (Powell et al., 1984). Stok bibit yang terinfeksi memberikan pengenalan awal virus ke area produksi buah. Perubahan dari budidaya bersih dengan membuang ke lahan sawah minimal telah memfasilitasi penularan virus melalui nematoda ke dandelion (Taraxacum officinale) dan spesies gulma lainnya. Seiring bertambahnya jumlah dandelion yang terinfeksi, maka kemungkinan penularan virus ke tanaman sehat juga meningkat. Tampaknya virus itu endemik pada dandelion dan gulma lainnya dan sifatnya yang mengakar.
Salah satu strategi jangka panjang yang berpotensi paling efektif untuk mengendalikan penyakit nepovirus adalah resistensi genetik. Idealnya, batang bawah harus memiliki ketahanan terhadap kerusakan langsung oleh nematoda dan kekebalan terhadap virus. Sebagai alternatif, tanaman berkayu yang berakar sendiri dapat dikembangkan untuk menoleransi nematoda dan infeksi virus. Kultivar raspberry yang terinfeksi menunjukkan perbedaan yang cukup besar dalam kemampuan mereka untuk bertahan hidup dan menghasilkan dan di daerah di mana virus menjadi masalah, menanam kultivar tahan direkomendasikan (Stace-Smith dan Converse, 1987).

Referensi :
Alcorn SM, Wilhelm S, Thomas HE, 1955. A mosaic disease of Himalaya blackberry. Phytopathology, 45:272-274.

Auger J, Converse RH, 1982. Raspberry bushy dwarf and tomato ringspot viruses in Chilean red raspberries. Acta Horticulturae, 129:9.

Bancroft JB, 1968. Tomato top necrosis virus. Phytopathology, 58:1360-1363.

Bozarth RF, Corbett MK, 1958. Tomato ringspot virus associated with stub or stub head disease of gladiolus in Florida. Plant Disease Reporter, 42:217-221.


Brierley P, 1954. Symptoms in florists' hydrangea caused by tomato ringspot virus and an unidentified sap-transmissible virus. Phytopathology, 44:696-699.

















No comments:

Post a Comment