Tomato ringspot virus
Salbiah
Balai Uji Terap Teknik dan Metode Karantina Pertanian
Nama umum : Ringspot of tomato
Nama ilmiah lainnya :
blackberry (Himalaya) mosaic virus
euonymus chlorotic ringspot virus
euonymus ringspot virus
grape yellow vein virus
grapevine yellow vein virus
nicotiana 13 virus
peach stem pitting virus
prune brown line virus
prunus stem pitting virus
red currant mosaic virus
tobacco ringspot virus 2
tomato ringspot nepovirus
ToRSV
winter peach mosaic virus
Kode EPPO : TORSV0 (Tomato ringspot nepovirus
Taksonomi :
Domain: Virus |
Group: "Positive sense ssRNA viruses" |
Group: "RNA viruses" |
Famili: Comoviridae |
Genus: Nepovirus |
Spesies: Tomato ringspot virus |
Deskripsi :
ToRSV
memiliki partikel isometrik berdiameter 28 nm (Stace-Smith, 1984). Virion tidak
terbungkus, bersudut dan tidak memiliki susunan kapsul yang mencolok. Genom
terdiri dari RNA beruntai tunggal dalam dua bagian. Virion ditemukan di
mesofil, sitoplasma dan plasmodesmata. Inklusi hadir pada sel yang terinfeksi
dan tidak biasa dalam bentuk; Mereka adalah vakuola besar di sitoplasma atau
kristal yang terdiri dari nukleoprotein (VIDE).
Sebaran :
ToRSV adalah endemik di
Amerika Utara, di mana ia terjadi di sepanjang pantai Pasifik dari British
Columbia selatan ke California dan di daerah sekitar Semenanjung Niagara di
Ontario dan negara bagian yang berdekatan dengan New York dan Pennsylvania. Ini
menyebabkan masalah penyakit serius di daerah di mana vektor nematoda juga
terjadi. Penyebaran alami terbatas pada daerah-daerah di mana terdapat populasi
vektor nematoda moderat hingga tinggi yang termasuk genus Xiphinema
(Stace-Smith, 1984).
Virus ini telah diisolasi
dari tanaman hias dan berry di bagian lain dunia namun ada sedikit bukti
penyebaran lapangan (Stace-Smith, l984). Isolasi telah dilakukan dari narcissus
di Jepang (Iwaki dan Komuro, 1971), pelargonium di Swedia (Ryden, 1972),
Inggris (Hollings et al., 1972), Belanda (Maat dan van Hoof, 1974) dan Denmark
(Christensen dan Paludan, 1978), raspberry (Rubus) di Yugoslavia (Jordovic et
al, l972), bekas Uni Soviet (Gordejchuk et al., 1977) dan Chile (Auger and
Converse, 1982) dan red currant (Ribes) di Selandia Baru ( Fry and Wood, 1978)
dan bekas USSR (Gordejchuk et al., 1977).
ToRSV telah terdeteksi dua
kali di Australia (Chu et al., 1983; Cook dan Dube, 1989). Kedua pendeteksian
tersebut dibuat pada tanaman hias dan tidak ada bukti penyebaran dari deteksi
terisolasi ini yang tercatat. Meskipun program pemantauan dan pengujian
dirancang khusus untuk mendeteksi virus ini yang dilakukan oleh petugas pertanian negara bagian dan teritori
serta Australian Quarantine and Inspection Service (AQIS), tidak ada
deteksi lebih lanjut dari patogen ini yang telah dibuat. ToRSV sekarang
diperkirakan akan dikendalikan dari Australia.
Asia : Cina, Iran, Jepang,
Yordania, Korea, Oman, Pakistan, Turki, Taiwan.
Afrika : Mesir, Tunisia.
Amerika Utara : Kanada,
Meksiko, California, Kansas, Florida, New York, Kentuky, Oklahoma, Pensilvania,
Texas, Cili, Venezuela.
Eropa : Belarus, Belgia, Bulgaria, Kroasia, Republik Ceko,
Denmark, Finlandia, Perancis, Jerman, Irlandia, Italia, Lithuania, Belanda,
Norwegia, Portugal, Rusia, Serbia, Slovakia, Swedia.
Oceania : Australia, New Zealand.
Resiko pemasukan :
Sebagian besar
spesies yang terinfeksi ToRSV cenderung pulih sehingga tidak ada gejala yang
jelas, sehingga menyulitkan petugas phytosanitary untuk mendeteksi secara
visual bahan tanaman yang terinfeksi. Terlepas dari karakteristik ini, virus
dianggap sebagai risiko phytosanitary minor. Ini karena prosedur deteksi yang
efektif tersedia dan program pengindeksan patogen terdapat di Kanada dan
Amerika Serikat. Akibatnya, virus tersebut tidak disebarkan oleh aktivitas
manusia di luar area dimana endemik. Stok pembibitan yang terkontaminasi tidak
dianggap sebagai sumber infeksi yang penting. Akan tetapi, kemungkinan
distribusi barang yang terkontaminasi secara tidak disengaja memainkan peran
penting dalam mengenalkan virus tersebut ke lahan pertanian yang baru dibersihkan
selama satu abad atau lebih.
Secara umum
bahwa virus tersebut dibatasi dalam distribusi alami ke wilayah tertentu di
Amerika Utara, terutama di sekitar Danau Besar dan Kawasan Pasifik, daerah
dimana vektor nematoda juga lazim. Virus ini telah diisolasi dari tanaman hias
dan berry di bagian lain dunia namun ada sedikit bukti penyebaran lapangan yang
terkait dengan kejadian terisolasi ini (Stace-Smith, l984). Isolasi telah
dilakukan dari narcissus di Jepang (Iwaki dan Komuro, 1971), pelargonium di Swedia
(Ryden, 1972), Inggris (Hollings et al., 1972), Belanda (Maat dan van Hoof,
1974) dan Denmark (Christensen dan Paludan, 1978), raspberry (Rubus) di
Yugoslavia (Jordovic et al, l972), bekas Uni Soviet (Gordejchuk et al., 1977)
dan Chile (Auger and Converse, 1982) dan red currant (Ribes) di Selandia Baru (
Fry and Wood, 1978) dan bekas USSR (Gordejchuk et al., 1977).
Tanaman inang : Buddleja davidii (butterfly bush) , Capsicum (peppers),
Cornus (Dogwood), Cucumis sativus (cucumber),
Cydonia oblonga (quince), Daphne mezereum (mezereon), Fragaria chiloensis (Chilean
strawberry),
Fraxinus americana (white ash), Gladiolus hybrids (sword lily), Hydrangea (hydrangeas), Lilium (lily), Lotus corniculatus (bird's-foot
trefoil),
Malus domestica (apple), Nicotiana tabacum (tobacco), Orchidaceae (orchids),
Pelargonium (pelargoniums),
Prunus (stone fruit), Prunus armeniaca (apricot), Prunus avium (sweet cherry), Prunus cerasus (sour cherry),
Prunus domestica (plum), Prunus persica (peach), Prunus salicina (Japanese plum), Ribes (currants), Rubus (blackberry, raspberry), Rubus idaeus (raspberry), Rubus procerus, Sambucus (Elderberry), Solanum lycopersicum (tomato), Taraxacum officinale complex
(dandelion), Vaccinium corymbosum (blueberry),
Vitis (grape), Vitis vinifera (grapevine).
Gejala : Gejala
ToRSV sangat berbeda pada tanaman yang berbeda. Pola Oakleaf, ringspot atau
yellow blotch pada dedaunan host abadi biasanya diamati pada tahun selanjutnya
setelah infeksi, namun pada tahun-tahun berikutnya, penurunan umum pada
pertumbuhan tanaman dan penurunan buah lebih sering terjadi daripada gejala
khas lainnya.
Gejala
penyakit raspberry berbeda tergantung kultivar, durasi infeksi dan stadium
pertumbuhan tanaman. Tanaman biasanya tidak menunjukkan gejala pada tahun
mereka terinfeksi tetapi pada musim semi tahun berikutnya,beberapa daun
menunjukkan cincin kuning, pola garis, atau klorosis vena. Gejala ini dapat
dianggap sebagai reaksi kejutan karena gejala daun yang berbeda jarang terjadi
pada tahun-tahun berikutnya. Gejala kronis termasuk tebu berbuah yang
terlambat, berbagai klorosis pada daun, pengurangan
hasil, buah yang cacat atau rapuh (Stace-Smith dan Converse, 1987).
Virus
ringspot tomat pada Prunus spp.
(Persik, nektarin, ceri manis, almond dan plum) menyebabkan berbagai gejala
buah, tunas, daun, dan batang. Gejala pertama pada pohon peach atau nektarin
yang baru terinfeksi adalah perkembangan bercak atau bintik kuning pada bilah
daun. Secara garis besar, berbulu dan biasanya mengikuti pembuluh darah utama.
Bintik-bintik biasanya terjadi pada bagian dasar daun dan didominasi pada satu
sisi pelepah. Blotching disertai distorsi daun, yang berupa menjepit, mengerut,
membungkuk dan membelah lateral ke daerah klorosis. Area klorotik sering mati,
mengakibatkan lubang dan tattering. Pada pohon yang terinfeksi kronis, gejala
kera-mosaik kuning paling jelas pada musim semi saat daun baru tumbuh.
Pertumbuhan beberapa tunas sangat terbelakang, menghasilkan daun kuning pucat
dan berubah menjadi coklat dan mati, menyebabkan kuncup yang terkena menonjol
kontras dengan daun yang muncul normal yang terkait dengan tunas lain di cabang
yang sama atau di bagian pohon yang lain. Tunas yang terkena memiliki dedaunan
yang agak jarang, penampilannya yang terbuka. Virus bergerak perlahan ke atas
sehingga, setelah beberapa tahun, buah diproduksi hanya di cabang. Gejala dapat
bervariasi tergantung pada umur pohon atau durasi infeksi dan perubahan iklim
dari tahun ke tahun (Smith dan Traylor, 1969; Smith et al., 1973; Schlocker dan
Traylor 1976). Buah tidak normal, daun nekrotik, warna tidak normal, dieback.
Biologi dan ekologi :
ToRSV memiliki distribusi geografis
yang luas di Amerika Utara dan mampu menginfeksi tanaman liar dan budidaya.
Terjadinya penyakit dahsyat yang terkait dengan virus ini berkorelasi dengan
terjadinya populasi vektor nematoda yang tinggi milik genus Xiphinema. Jika
virus disebarluaskan dalam menanam bahan ke daerah dimana Xiphinema spp. Tidak
ada atau ada dalam jumlah rendah, biasanya tidak penting.
Sebagian besar studi vektor telah
dilakukan dengan populasi nematoda yang diidentifikasi sebagai Xiphinema americanum. X. americanum, X. rivesi dianggap sebagai vektor virus
yang penting di Amerika Serikat bagian timur (Forer and Stouffer, 1982;
Rosenberger et al., 1983; Mountain et al., 1983) dan X. californicum di USA bagian barat (Hoy et al., 1984). Virus
ditransmisikan pada tahap dewasa dan larva X.
americanum, diperoleh dalam waktu satu jam dan dapat diinokulasi ke tanaman
sehat dalam waktu satu jam (Teliz et al., 1966). Dalam penanaman raspberry,
penyebaran rata-rata sekitar 2 m per tahun (Converse dan Stace-Smith, l971).
Dimana penyebaran aktif terjadi, virus bergerak lebih cepat dari tanaman ke
tanaman di sepanjang baris daripada bergerak di antara baris (Stace-Smith dan
Converse, 1987).
Stok pembibitan yang terkontaminasi
tidak dianggap sebagai sumber infeksi yang penting. Karena virus ini biasa
terjadi di kebun apel dan bertahan dalam proporsi benih dari tanaman yang
terinfeksi, benih dandelion yang terinfeksi diperkirakan merupakan sumber utama
penyebaran antar kebun dan intra-kebun. Nematoda vektor, yang lazim di banyak
kebun buah, dapat memperoleh virus dari host gulma kebun dan memindahkannya ke
pohon apel (Powell et al., 1984).
Aspek
terbawa benih :
ToRSV telah terbukti terbawa benih di beberapa
spesies termasuk kacang kedelai (Kahn, 1956; D McGee, Iowa State University, Iowa,
Amerika Serikat, stroberi (Mellor dan Stace-Smith, 1963), raspberry (Braun dan
Keplinger, 1973), pelargonium (Scarborough dan Smith, 1977) dan dandelion
(Mountain et al., 1983). Transmisi serbuk sari ke benih telah ditunjukkan pada
pelargonium (Scarborough dan Smith, 1977).
Raspberry yang terinfeksi ToRSV dapat menunjukkan
ukuran berry yang abnormal dan berry yang rapuh karena infeksi mempengaruhi
kualitas benih. Dalam penelitian yang melibatkan 10 kultivar, beberapa
menunjukkan penurunan hasil pada tahun tanam ketiga sedangkan varietas lainnya
tidak menunjukkan penurunan hasil yang signifikan (Freeman et al., 1975).
Drupelet set juga bervariasi dengan kultivar, beberapa menunjukkan efek yang
sangat merugikan sedangkan yang lain tidak terpengaruh atau terpengaruh pada
tingkat yang lebih rendah (Daubeny et al., 1975).
Kecuali stroberi (Mellor dan Stace-Smith, 1963),
tidak ada bukti yang meyakinkan untuk mentransmisikan ToRSV dari benih ke bibit
di inang manapun. Benih yang dipanen dari tanaman kedelai yang diinokulasi
ditanam di rumah kaca ditanam di rumah kaca dan patogen tercatat pada 76%
bibit. Kehadiran virus pada bibit berumur 3 minggu dikonfirmasi oleh
perkembangan gejala dan dengan menginokulasi jaringan ke tanaman indikator
(Kahn, 1956). Namun, tidak ada indikasi bahwa tindakan pencegahan dilakukan
dalam penelitian ini untuk mencegah sumber inokulum alternatif. Selanjutnya,
transmisi benih belum ditunjukkan oleh bibit dari tanaman kedelai yang
terinfeksi secara alami.
Laboratorium Pengujian Benih Laboratorium
Universitas Iowa State telah mengadaptasi sebuah kit diagnostik yang diproduksi
oleh Agdia Unc, Elkhart, Indiana, AS, untuk menguji ToMRV dalam biji. Metode
ini tersedia di website Sistem Benih Kesehatan USDA.
Virus tersebut telah terdeteksi pada benih stroberi
yang terinfeksi dengan cara menabur benih dan mentransmisikan virus secara
mekanis dari bibit yang terinfeksi ke tanaman uji.
Dampak
:
ToRSV
tersebar luas pada banyak spesies tanaman dan menyebabkan penurunan
produktivitas yang parah sehingga merupakan salah satu virus tanaman yang
paling merusak di Amerika Utara. Virus ini lazim terjadi pada dandelion dan
gulma lainnya (Powell et al., 1982), dan dapat disebarluaskan pada jarak yang
cukup jauh pada biji windwown dari dandelion yang terinfeksi (Rosenberger et
al., 1983). Selanjutnya, dandelion dan gulma lainnya menyediakan reservoir
untuk akuisisi virus oleh vektor nematoda.
ToRSV
merupakan masalah ekonomi yang serius di daerah di mana vektor nematoda terjadi
(lihat Biologi dan Ekologi). Untungnya,
penyebaran virus aktif dibatasi pada jenis tanah tertentu. Di wilayah
yang berkembang dengan raspberry di Pacific Northwest, misalnya, relatif
sedikit yang terinfeksi, namun di mana virus ini lazim, kehilangan panen sangat
luas (Converse et al., 1970).
Penurunan
hasil di berbagai inang sulit untuk dinilai karena respon terhadap infeksi
bervariasi sesuai dengan kultivar dan durasi infeksi. Dalam penelitian tentang
raspberry, antara 10 dan 80% batang raspberry mati sebagian atau seluruhnya 3
tahun setelah terinfeksi (Freeman dan Stace-Smith, 1968). Dalam studi lapangan
lainnya, Converse dan Stace-Smith (1971) mengamati bahwa buah dari tebu yang
terinfeksi beratnya 21% kurang dari buah normal dan hasil tanaman berpenyakit
berkurang sebesar> 50%.
Diagnosis :
Dua
tes untuk diagnosis ToRSV berguna: transmisi dari inang ke inang atau tes
serologis. Transmisi Sap dari inang yang terinfeksi ke spesies inang didapat
sehingga menghasilkan jaringan daun digunakan sebagai sumber inokulum.
Penyangga fosfat (0,02 M, pH 7,5, mengandung 2% nikotin) dapat digunakan. Inang
indikator yang paling berguna adalah Chenopodium
quinoa dan Cucumis sativus.
Bioassays
dan agar gel serologi efektif digunakan dengan dedaunan yang diproduksi di
musim semi, namun seiring dengan berkembangnya musim panas, menjadi sulit untuk
mendeteksi infeksi. Uji immunosorbent enzyme-linked (ELISA) adalah yang paling
dapat diandalkan dan dapat digunakan untuk mendeteksi virus pada sampel daun,
batang, tunas dan akar dari tanaman yang terinfeksi (Converse, 1978). ELISA
sekarang banyak digunakan untuk survei lapangan.
Tes
serologis memiliki keuntungan tambahan bahwa virus diidentifikasi secara
spesifik, sedangkan bioassay dapat mendeteksi infeksi nepovirus namun tidak
cukup berbeda untuk menentukan identitas nepovirus yang tepat.
Virus
ringspot tomat terdeteksi dengan tepat menggunakan uji RT-PCR real-time oleh
Zhu et al. (2003). DAS-ELISA, PCR multipleks dan PCR semi-nested juga telah
berhasil digunakan (Wen et al 2007; Cui et al., 2012).
Deteksi dan infeksi :
Masalah yang dihadapi dalam deteksi dan identifikasi ToRSV pada raspberry adalah masalah dalam mendeteksi virus di inang lainnya. Infeksi pada raspberry dapat dideteksi melalui pemeriksaan di lapangan, terutama jika survei dilakukan di musim semi ketika gejala dedaunan paling menonjol (Vaughan et al., 1951; Converse et al., 1970). Survei lapangan mendeteksi tingginya proporsi infeksi baru namun proporsi tanaman kronis yang terinfeksi. Beberapa kultivar sensitif menunjukkan tanda-tanda foliar di tahun-tahun terakhir; Kultivar lain tidak menunjukkan gejala (Stace-Smith dan Converse, 1987).
Selama
bertahun-tahun, para pekerja mengandalkan gejala lapangan untuk deteksi dan
inspeksi. Karena tidak adanya gejala tidak berarti tidak adanya infeksi,
pemeriksaan visual harus dilengkapi dengan tes yang mampu mendeteksi infeksi
laten. Inspeksi visual biasanya dilengkapi dengan transmisi ke indikator
tanaman atau tes serologis.
Identifikasi
vektor nematoda potensial, populasi mereka di berbagai kedalaman tanah, dan
distribusi lapangan mereka juga penting dalam mengendalikan virus, terutama
pada tanaman tahunan. Seseorang melakukan sampling sebelum menanam ladang baru
atau menanam kembali ladang lama. Vektor adalah ektoparasit dan lebih mudah
untuk sampel dari endoparasit. Faktor-faktor seperti waktu tahun, tipe dan
tekstur tanah, sistem akar tanaman tanaman dan gulma dan drainase tanah
memiliki pengaruh pada sampel dalam penilaian yang akurat terhadap populasi
nematoda. Persentase tinggi kebun buah dan kebun anggur di Amerika Utara telah
ditanam tanpa sampling nematoda sebelumnya. ToRSV dan penyakit nepovirus
lainnya menjadi jelas dalam penanaman tanaman berkayu, para petani menjadi
sadar akan kebutuhan untuk melakukan sampeling nematoda sebelum penanaman
(Stace-Smith dan Ramsdell, 1987).
Pencegahan dan pengendalian :
Infeksi ToRSV biasanya tidak terdeteksi pada
penanaman lahan tanaman tahunan sampai virus tersebut menyebar. Pada tahap ini
sedikit yang bisa dilakukan untuk mencegah virus dan pengendaliannya yang
sulit. Tanaman yang menunjukkan gejala dapat dihilangkan dan ditanam kembali
dengan persediaan yang sehat.
Stok tanaman uang bebas virus adalah fondasi untuk
pencegahan penyakit nepovirus. Di California, Amerika Serikat, jutaan selai
grapevine dan kultivar yang dicangkokkan ke batang bawah disebarkan bebas dari
virus sebagai akibat kultur thermotherapy dan shoot-tip (Nyland dan Goheen,
1969). Perkembangan terbaru dalam metode deteksi dan virus telah menghasilkan
prosedur terapeutik yang efektif (Spiegel et al., 1993).
Meskipun
penyebaran tomat ringspot nepovirus dari Amerika Utara ke daerah lain di dunia
terbatas, ada cukup banyak laporan dalam literatur untuk menarik perhatian.
Mengumpulkan, konservasi dan pemanfaatan sumber daya genetik tanaman dan
distribusi global mereka merupakan komponen penting dalam program peningkatan
tanaman. Tak pelak lagi, pergerakan plasma nutfah melibatkan risiko tanpa
sengaja mengenalkan hama karantina tumbuhan bersamaan dengan bahan tanaman
inang, terutama dengan virus seperti tomat ringspot nepovirus yang sering tanpa
gejala. Volume plasma nutfah yang terus meningkat yang dipertukarkan secara internasional
telah menciptakan kebutuhan akan keamanan fitosanitasi transfer plasma nutfah.
Hal ini mendorong pengembangan pedoman dan rekomendasi yang diterima secara
internasional untuk pergerakan plasma nutfah yang aman dan cepat (Frison and
Ikin, 1991; Dickmann et al., 1994). Rekomendasi umum adalah bahwa dalam keadaan
apapun plasma nutfah tidak dipindahkan sebagai bahan tanaman yang berakar,
Plasma nutfah sebaiknya dipindahkan sebagai kultur in vitro, bila tersedia,
aksesi atau kultivar harus diperoleh dari koleksi yang diuji patogen atau dari
area dengan risiko terendah dan semua bahan harus menjalani prosedur dan
pengindeksan (Spiegel et al., 1993).
Banyak
perhatian telah diberikan pada kemungkinan gulma pada epidemiologi dan
penyebaran nepovirus ringspot tomat. Dalam sebuah penelitian untuk menilai
tingkat gulma kebun yang terinfeksi dengan tomat ringspot nepovirus di apel
yang sakit dan kebun buah persik di Amerika Serikat bagian timur, 21 spesies
gulma tahunan ditemukan terinfeksi virus (Powell et al., 1984). Stok bibit yang
terinfeksi memberikan pengenalan awal virus ke area produksi buah. Perubahan
dari budidaya bersih dengan membuang ke lahan sawah minimal telah memfasilitasi
penularan virus melalui nematoda ke dandelion (Taraxacum officinale) dan spesies
gulma lainnya. Seiring bertambahnya jumlah dandelion yang terinfeksi, maka
kemungkinan penularan virus ke tanaman sehat juga meningkat. Tampaknya virus
itu endemik pada dandelion dan gulma lainnya dan sifatnya yang mengakar.
Salah satu
strategi jangka panjang yang berpotensi paling efektif untuk mengendalikan
penyakit nepovirus adalah resistensi genetik. Idealnya, batang bawah harus
memiliki ketahanan terhadap kerusakan langsung oleh nematoda dan kekebalan
terhadap virus. Sebagai alternatif, tanaman berkayu yang berakar sendiri dapat
dikembangkan untuk menoleransi nematoda dan infeksi virus. Kultivar raspberry
yang terinfeksi menunjukkan perbedaan yang cukup besar dalam kemampuan mereka
untuk bertahan hidup dan menghasilkan dan di daerah di mana virus menjadi
masalah, menanam kultivar tahan direkomendasikan (Stace-Smith dan Converse,
1987).
Referensi :
Alcorn SM, Wilhelm S, Thomas HE, 1955. A mosaic disease of Himalaya blackberry. Phytopathology, 45:272-274.
Auger J, Converse RH, 1982. Raspberry bushy dwarf and tomato ringspot viruses in Chilean red raspberries. Acta Horticulturae, 129:9.
Bancroft JB, 1968. Tomato top necrosis virus. Phytopathology, 58:1360-1363.
Bozarth RF, Corbett MK, 1958. Tomato ringspot virus associated with stub or stub head disease of gladiolus in Florida. Plant Disease Reporter, 42:217-221.
Brierley P, 1954. Symptoms in florists' hydrangea caused by tomato ringspot virus and an unidentified sap-transmissible virus. Phytopathology, 44:696-699.
Comments
Post a Comment